More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1299 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1299  nitrogen regulatory protein P-II, putative  100 
 
 
105 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.083836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.48 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0297  nitrogen regulatory protein P-II  45 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.243137  normal  0.337572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4762  nitrogen regulatory protein P-II  41.9 
 
 
111 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.830255  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  27.18 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  28.28 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0977  nitrogen regulatory protein P-II, putative  37.14 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  32.04 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  32.04 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  32.69 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  31.73 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.77 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_003296  RS00410  P-II-like protein transcription regulator  35.92 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  32.04 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  36.19 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  36.19 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  27.88 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  31.73 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  32.69 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  31.73 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  32.69 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  29.81 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  31.07 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  34.29 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  33.01 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.69 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  29.81 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  35.24 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1023  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350926  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  31.07 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.69 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  31.07 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  30.1 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  29.13 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>