More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0297 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0297  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.243137  normal  0.337572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.37 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4762  nitrogen regulatory protein P-II  44.55 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.830255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1299  nitrogen regulatory protein P-II, putative  45 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.083836  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4681  nitrogen regulatory protein P-II  37.38 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.554107 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3604  nitrogen regulatory protein P-II  37.38 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0682477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00410  P-II-like protein transcription regulator  37.38 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  41.58 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  41.58 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  40.59 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.61 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0977  nitrogen regulatory protein P-II, putative  39.22 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  37.62 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1638  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.39 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  38.61 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  38.61 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  34.82 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  37.62 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.61 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  37.62 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  40.59 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.62 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.62 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.62 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.62 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  37.62 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  36.63 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  37.62 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  36.63 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  37.62 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  40.59 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  36.63 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  34.65 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  36.63 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  37.62 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  35.71 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  33.93 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  37.62 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  35.35 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  37.37 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  33.04 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  36.63 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  37.62 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.64 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  33.04 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.64 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  33.04 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  33.04 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  32.14 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  34.82 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  34.65 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  34.82 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  37.62 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  34.65 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.93 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  33.93 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  35 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2211  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  32.14 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  32.77 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.93 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  34.82 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  34.65 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  33.04 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2134  nitrogen regulatory protein P-II, putative  37.62 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  32.67 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  33.66 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  33.66 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  32.14 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  31.25 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  33.04 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  35.64 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>