More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0505 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 
111 aa  222  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1299  nitrogen regulatory protein P-II, putative  50.48 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.083836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0297  nitrogen regulatory protein P-II  54.37 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.243137  normal  0.337572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4762  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
111 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.830255  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  42.31 
 
 
112 aa  84  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.23 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  41.35 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  40.78 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  41.75 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0977  nitrogen regulatory protein P-II, putative  40.38 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  35.85 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.42 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.46 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  38.46 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.38 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  39.42 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  40.78 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  40.78 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  40.78 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  40.78 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.5 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.42 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  40.38 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  35.4 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  37.86 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  35.4 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>