More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0977 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0977  nitrogen regulatory protein P-II, putative  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1638  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.82 
 
 		 112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.38 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  34.55 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  34.55 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  36.89 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  34.55 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  34.55 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  33.64 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  36.45 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  33.64 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  33.64 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  36.45 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  33.64 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1299  nitrogen regulatory protein P-II, putative  37.14 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.083836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0297  nitrogen regulatory protein P-II  39.22 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.243137  normal  0.337572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  33.64 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  33.64 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  36.45 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  33.64 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  33.64 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.55 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  35.51 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  34.86 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  40.19 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  35.4 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  30.91 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  35.11 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  33.96 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  33.96 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4762  nitrogen regulatory protein P-II  34.91 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.830255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.55 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  34.55 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  33.94 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  34.51 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  30.91 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  33.64 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  34.55 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2547  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0889  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.51 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  34.51 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  33.64 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  31.82 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  32.71 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  35.45 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  30.91 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>