More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0831 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  100 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  78.76 
 
 		 113 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2134  nitrogen regulatory protein P-II, putative  74.34 
 
 		 113 aa  158  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  103  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.9 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  47.79 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.9 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  95.9  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.02 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.25 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  44.25 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  43.36 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  44.25 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  42.48 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  43.36 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  42.48 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  42.48 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  43.36 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  45.13 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2217  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.13 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3047  nitrogen regulatory protein P-II  40.71 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.414736  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  42.48 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>