More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2134 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2134  nitrogen regulatory protein P-II, putative  100 
 
 		 113 aa  224  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  77.88 
 
 		 113 aa  181  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  74.34 
 
 		 113 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  50.44 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.9 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  46.02 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.56 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  45.13 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  47.79 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.56 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.56 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  46.9 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.67 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.56 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.02 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.56 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  49.56 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  46.02 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 		 112 aa  100  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>