More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4762 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4762  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.830255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0297  nitrogen regulatory protein P-II  44.55 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.243137  normal  0.337572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1299  nitrogen regulatory protein P-II, putative  41.9 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.083836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.67 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2211  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4681  nitrogen regulatory protein P-II  34.29 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.554107 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3604  nitrogen regulatory protein P-II  34.29 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0682477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00410  P-II-like protein transcription regulator  34.29 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  35.19 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  34.86 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0977  nitrogen regulatory protein P-II, putative  34.91 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  33.33 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1114  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.56 
 
 		 54 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.26 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.58 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.11 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  32.71 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  36.11 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  32.41 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.56 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  29.63 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  28.7 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  34.55 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  29.63 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  30.56 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  32.41 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.63 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  31.82 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  30.56 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  30.56 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  33.64 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  28.7 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  30.56 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.33 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  28.18 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  30.28 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  30.56 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  32.73 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2134  nitrogen regulatory protein P-II, putative  34.91 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  29.63 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  29.63 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  31.48 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>