More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00410 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00410  P-II-like protein transcription regulator  100 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4681  nitrogen regulatory protein P-II  85.98 
 
 		 107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.554107 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3604  nitrogen regulatory protein P-II  85.98 
 
 		 107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0682477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0297  nitrogen regulatory protein P-II  37.38 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.243137  normal  0.337572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.41 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4762  nitrogen regulatory protein P-II  34.29 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.830255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1299  nitrogen regulatory protein P-II, putative  35.92 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.083836  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  32.71 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  34.02 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  34.02 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  30.93 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  28.87 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  34.02 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  31.58 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  32.99 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2134  nitrogen regulatory protein P-II, putative  31.96 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  32.71 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.71 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  32.99 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  31.96 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  32.99 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  32.71 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  29.91 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  32.99 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  36.56 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  32.99 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0977  nitrogen regulatory protein P-II, putative  32.99 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.51 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  31.96 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  35.51 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>