More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2211 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2211  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  229  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  40.71 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  41.59 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 
112 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  38.94 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  35.4 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  87.4  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.17 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.82 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  38.94 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 
112 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 
112 aa  84.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0506  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  36.28 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0503  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0597213  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0522  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3251  nitrogen regulatory protein P-II 2  36.28 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  38.05 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  37.17 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  36.28 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  36.28 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0512  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0565  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.941752  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  36.28 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  36.28 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  36.28 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00402  nitrogen assimilation regulatory protein for GlnL, GlnE, and AmtB  35.4 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  35.4 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  34.51 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  34.51 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.28 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0494  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  34.51 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0918  nitrogen regulatory protein P-II 2  34.51 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  35.4 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3165  nitrogen regulatory protein P-II 2  35.4 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  35.4 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  38.05 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  35.4 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  38.05 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  35.4 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  34.51 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>