More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4681 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3604  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 107 aa  221  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0682477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4681  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 107 aa  221  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.554107 
 
 
-
 
NC_003296  RS00410  P-II-like protein transcription regulator  85.98 
 
 		 107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0297  nitrogen regulatory protein P-II  37.38 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.243137  normal  0.337572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.86 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4762  nitrogen regulatory protein P-II  34.29 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.830255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1299  nitrogen regulatory protein P-II, putative  33.01 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.083836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  27.84 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  30.84 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  36.45 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  31.78 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  28.87 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  30.84 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  30.84 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  30.84 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  30.84 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  30.84 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2134  nitrogen regulatory protein P-II, putative  29.9 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  30.53 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.91 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  28.97 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0889  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  31.78 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2547  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  28.04 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  26.17 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.84 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  31.78 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  30.93 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  29.9 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  29.9 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  27.1 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  34.58 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  28.97 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0977  nitrogen regulatory protein P-II, putative  30.93 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  28.04 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0119  nitrogen regulatory protein P-II  33.64 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  29.9 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.9 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1638  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.59 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  27.84 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  29.9 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  29.9 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  29.9 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  29.9 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  30.84 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  29.9 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>