More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1339 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 		 112 aa  220  6e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 136 aa  153  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 117 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 117 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  62.5 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  62.5 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  61.61 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1302  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>