221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03034 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03034  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 395 aa  813    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000138857  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  63.82 
 
 		 870 aa  527  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  47.68 
 
 		 857 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  47.44 
 
 		 861 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  47.44 
 
 		 861 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  47.44 
 
 		 861 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  48.07 
 
 		 861 aa  364  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  48.21 
 
 		 856 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
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NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  47.66 
 
 		 859 aa  362  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
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NC_011663  Sbal223_2904  PII uridylyl-transferase  47.91 
 
 		 861 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0760318  normal  0.279173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1443  PII uridylyl-transferase  47.64 
 
 		 861 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1448  PII uridylyl-transferase  47.64 
 
 		 861 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  47.64 
 
 		 861 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  47.04 
 
 		 860 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  46.77 
 
 		 851 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  46.02 
 
 		 861 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  46.97 
 
 		 857 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  46.39 
 
 		 859 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
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NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  46.25 
 
 		 874 aa  348  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  46.21 
 
 		 904 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  45.69 
 
 		 903 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  44.19 
 
 		 874 aa  341  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  45.36 
 
 		 893 aa  338  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  45.43 
 
 		 890 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  44.82 
 
 		 891 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  45.08 
 
 		 892 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  44.65 
 
 		 890 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  44.65 
 
 		 890 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  44.65 
 
 		 890 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  43.49 
 
 		 881 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  44.39 
 
 		 890 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  44.39 
 
 		 890 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  44.39 
 
 		 890 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.39 
 
 		 890 aa  332  6e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  44.39 
 
 		 890 aa  332  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  44.39 
 
 		 890 aa  332  6e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.82 
 
 		 869 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.38403 
 
 
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NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  43.75 
 
 		 912 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  43.75 
 
 		 893 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  43.75 
 
 		 893 aa  328  7e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  43.48 
 
 		 890 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  43.22 
 
 		 890 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  43.22 
 
 		 890 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  43.22 
 
 		 890 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  42.97 
 
 		 890 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  43.51 
 
 		 883 aa  322  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.08 
 
 		 894 aa  318  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  41.48 
 
 		 891 aa  312  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  38.95 
 
 		 900 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
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NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  38.95 
 
 		 900 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  38.68 
 
 		 900 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
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NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  41.55 
 
 		 899 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  39.43 
 
 		 878 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  38.95 
 
 		 900 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
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NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  40.46 
 
 		 889 aa  296  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  41.24 
 
 		 877 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  40.27 
 
 		 900 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.69 
 
 		 893 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  41.82 
 
 		 881 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  39.06 
 
 		 897 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
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NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  39.21 
 
 		 898 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  39.21 
 
 		 898 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  39.19 
 
 		 899 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  39.41 
 
 		 900 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008309  HS_0829  PII uridylyl-transferase  40.62 
 
 		 861 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  39.41 
 
 		 900 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  39.54 
 
 		 900 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  39.34 
 
 		 899 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  38.48 
 
 		 892 aa  273  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0556  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 		 899 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258602 
 
 
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NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  38.36 
 
 		 875 aa  253  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2877  protein-P-II uridylyltransferase  37.92 
 
 		 874 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.521501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0910  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.46 
 
 		 882 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0445386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  36.96 
 
 		 861 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  36.96 
 
 		 861 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0395  protein-P-II uridylyltransferase  34.52 
 
 		 915 aa  245  9e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919932 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0441  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  34.53 
 
 		 913 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3746  (protein-PII) uridylyltransferase  36.79 
 
 		 867 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  38.01 
 
 		 858 aa  242  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3942  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.05 
 
 		 868 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  33.33 
 
 		 888 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  33.51 
 
 		 856 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01140  PII uridylyl-transferase  36.71 
 
 		 838 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  36.24 
 
 		 852 aa  229  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  36.96 
 
 		 884 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  36.36 
 
 		 861 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2942  PII uridylyl-transferase  35.58 
 
 		 868 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  34.58 
 
 		 887 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  35.79 
 
 		 859 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  33.85 
 
 		 858 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  33.85 
 
 		 858 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  33.93 
 
 		 858 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  33.85 
 
 		 858 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  36.29 
 
 		 862 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  34.84 
 
 		 869 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.29 
 
 		 862 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  33.68 
 
 		 858 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
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NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  34.13 
 
 		 858 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  33.68 
 
 		 858 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A1759  PII uridylyl-transferase  34.36 
 
 		 875 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.308233 
 
 
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