77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1270 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1270  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 333 aa  684    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.551057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0559  adenine-specific DNA methylase-like protein  36.43 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2709  N-6 DNA methylase  31.29 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  32.12 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  32.12 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  31 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  31.52 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  31.52 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4469  putative adenine-specific DNA methyltransferase  31 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0488  hypothetical protein  30.7 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.682666 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  31 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3311  N-6 DNA methylase  30.65 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  31 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  30.4 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  30.4 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1803  hypothetical protein  32.66 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1768  hypothetical protein  32.66 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  30.98 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0468  adenine-specific DNA methylase  28.79 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  29.6 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0167  hypothetical protein  28.11 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2296  hypothetical protein  27.73 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  24.23 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  22.48 
 
 		 891 aa  56.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  25.58 
 
 		 554 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  26.39 
 
 		 528 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  23.42 
 
 		 730 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  25.79 
 
 		 535 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  23.78 
 
 		 480 aa  53.5  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  27.23 
 
 		 547 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 1362 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  25.35 
 
 		 535 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  26.72 
 
 		 537 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  25.24 
 
 		 540 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  26.72 
 
 		 537 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  24.87 
 
 		 808 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  23.47 
 
 		 537 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  25.78 
 
 		 484 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  20.2 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  22.87 
 
 		 493 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  25.88 
 
 		 505 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  21.59 
 
 		 489 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  29.3 
 
 		 521 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  22.71 
 
 		 489 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  22.71 
 
 		 489 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  22.97 
 
 		 799 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  26.85 
 
 		 518 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  26.99 
 
 		 534 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  23.87 
 
 		 526 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  23.12 
 
 		 486 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  23.04 
 
 		 493 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  21.25 
 
 		 481 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  26.83 
 
 		 523 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  24.44 
 
 		 477 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.86 
 
 		 644 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  24.27 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  22.92 
 
 		 834 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  25.26 
 
 		 488 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  23.08 
 
 		 479 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  23.04 
 
 		 816 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  22.64 
 
 		 494 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.04 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  20.57 
 
 		 501 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  26.36 
 
 		 537 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  24.38 
 
 		 495 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  23.63 
 
 		 707 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  24.4 
 
 		 481 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3269  N-6 DNA methylase  22.22 
 
 		 630 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000126055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  22.64 
 
 		 846 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  27.42 
 
 		 522 aa  43.9  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 775 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 539 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.66 
 
 		 533 aa  42.7  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  23.94 
 
 		 489 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2987  N-6 DNA methylase  26.17 
 
 		 692 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0736  N-6 DNA methylase  26.46 
 
 		 725 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0698793  normal  0.0155301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  27.44 
 
 		 519 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>