28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0468 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0468  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 
329 aa  667    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0559  adenine-specific DNA methylase-like protein  34.87 
 
 
277 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1803  hypothetical protein  32.81 
 
 
315 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1768  hypothetical protein  32.81 
 
 
315 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2709  N-6 DNA methylase  28.26 
 
 
329 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  30.86 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  25.62 
 
 
328 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  25.31 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4469  putative adenine-specific DNA methyltransferase  25.91 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0488  hypothetical protein  25.31 
 
 
328 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.682666 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  25.23 
 
 
330 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  25.23 
 
 
328 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  25.86 
 
 
330 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  25.86 
 
 
330 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  25.31 
 
 
328 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  25.23 
 
 
330 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  32.06 
 
 
329 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3311  N-6 DNA methylase  26.56 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1270  adenine-specific DNA methylase  28.79 
 
 
333 aa  126  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.551057  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  27.64 
 
 
318 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0167  hypothetical protein  28.63 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2296  hypothetical protein  28.27 
 
 
312 aa  112  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5275  N-6 DNA methylase  23.08 
 
 
623 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  21.52 
 
 
730 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  23.65 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3269  N-6 DNA methylase  23.43 
 
 
630 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000126055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  23.08 
 
 
481 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  23.84 
 
 
477 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>