31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0559 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0559  adenine-specific DNA methylase-like protein  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  40.15 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2709  N-6 DNA methylase  40.29 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  38.55 
 
 		 328 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  38.55 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0488  hypothetical protein  37.82 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.682666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  37.82 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  37.82 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  37.45 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  37.45 
 
 		 330 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4469  putative adenine-specific DNA methyltransferase  37.45 
 
 		 328 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3311  N-6 DNA methylase  36.23 
 
 		 329 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  36.58 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1768  hypothetical protein  35.8 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1803  hypothetical protein  35.8 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1270  adenine-specific DNA methylase  36.43 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.551057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0468  adenine-specific DNA methylase  34.87 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  33.58 
 
 		 318 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2296  hypothetical protein  35.58 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0167  hypothetical protein  31.85 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.86 
 
 		 644 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  24 
 
 		 1706 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  21.29 
 
 		 730 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  24.3 
 
 		 1362 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  20.62 
 
 		 626 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  23.28 
 
 		 547 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  23.21 
 
 		 518 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  24.26 
 
 		 523 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  20.18 
 
 		 554 aa  42.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>