23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2296 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2296  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  633  1e-180  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0167  hypothetical protein  49.2 
 
 
324 aa  311  1e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  49.84 
 
 
318 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  33.79 
 
 
329 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  33.09 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  32.73 
 
 
330 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2709  N-6 DNA methylase  34.04 
 
 
329 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0559  adenine-specific DNA methylase-like protein  35.58 
 
 
277 aa  151  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  32.73 
 
 
330 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4469  putative adenine-specific DNA methyltransferase  32.84 
 
 
328 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  32.73 
 
 
328 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  32.36 
 
 
330 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  32.36 
 
 
330 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3311  N-6 DNA methylase  32.48 
 
 
329 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  32.36 
 
 
330 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  31.75 
 
 
328 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0488  hypothetical protein  32.1 
 
 
328 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.682666 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1768  hypothetical protein  33.47 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1803  hypothetical protein  33.47 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  31.84 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0468  adenine-specific DNA methylase  28.27 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1270  adenine-specific DNA methylase  27.73 
 
 
333 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.551057  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24.29 
 
 
730 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>