More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1656 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1656  SMR family multidrug efflux pump  100 
 
 
104 aa  201  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0999072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0331  SMR family multidrug efflux pump  95.19 
 
 
104 aa  193  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  95.19 
 
 
104 aa  192  9e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1391  putative multidrug resistance protein, SMR family  87.5 
 
 
104 aa  176  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.541749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1887  sugE protein  45.19 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  45.19 
 
 
104 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  45.19 
 
 
104 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  45.19 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  45.19 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  45.19 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  45.19 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  45.19 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  45.19 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  45.19 
 
 
104 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  38.46 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  38.46 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1074  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000173612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0745  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0729  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.46 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00310147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0926  sugE protein, putative  38.46 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0363634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0928  putative sugE protein  38.46 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.81419e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0793  sugE protein  38.46 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000122325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0742  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.46 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00206862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0997  putative sugE protein  38.46 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000051913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0833  sugE protein  38.46 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000128265  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0108  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1335  multidrug resistance protein YkkD  38.82 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  32.71 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4446  putative sugE protein  38.68 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881234  normal  0.621575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  36.27 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  34.58 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0888  putative sugE protein  38.68 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  36.27 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  35.29 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  37.08 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  34.31 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0113  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  34.29 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  31.73 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  39.47 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  37.68 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  32.11 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  39.05 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  39.05 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0758  sugE protein  37.86 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.748062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  39.05 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 
105 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  30.84 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2329  small multidrug resistance protein  36.47 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 
106 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1182  multidrug resistance protein YkkD  38.14 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  31.48 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  29.91 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2190  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  37.63 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  28.43 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  33.33 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  32.41 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  31.37 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
109 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  32.41 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 
106 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  31.68 
 
 
104 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  30.91 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  28.43 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>