246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2190 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2190  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 104 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  41.75 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  42.72 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0108  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  37.5 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  37.5 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  39.05 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  36.7 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.65 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  37.25 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  35.85 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  37.5 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.64 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0113  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  34.86 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.94 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  33.94 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.94 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.94 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.94 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  33.03 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.94 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.94 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  33.94 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  33.94 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  33.94 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  35.58 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  32.11 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  34.91 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1074  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000173612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  36.79 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0758  sugE protein  38.1 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.748062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  34.91 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  34.91 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  34.91 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  34.91 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  34.91 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  34.91 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  34.91 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  36.59 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0621  small multidrug resistance protein  31.48 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.852662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  32.11 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1727  exporter protein  35.24 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  31.48 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1656  SMR family multidrug efflux pump  34.29 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0999072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  30.39 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1212  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0428006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  30.39 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1338  membrane transporter  30.77 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.265274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  30.39 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  30.39 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  30.39 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  30.39 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4733  transporter  49.15 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>