More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0108 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0108  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 106 aa  196  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  35.29 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0793  sugE protein  42.16 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000122325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0742  quaternary ammonium compound-resistance protein  42.16 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00206862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  35.29 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0997  putative sugE protein  42.16 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000051913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0833  sugE protein  42.16 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000128265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0928  putative sugE protein  42.16 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.81419e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0926  sugE protein, putative  42.16 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0363634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0729  quaternary ammonium compound-resistance protein  42.16 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00310147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  41.18 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  41.18 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0745  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  41.18 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  41.18 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  41.18 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  41.18 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  41.18 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4446  putative sugE protein  40.2 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881234  normal  0.621575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0888  putative sugE protein  40.2 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1074  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000173612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  39.6 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  39.6 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1887  sugE protein  43.14 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2190  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1391  putative multidrug resistance protein, SMR family  33.01 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.541749  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  33.96 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  44 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1656  SMR family multidrug efflux pump  33.96 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0999072  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  42.72 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0331  SMR family multidrug efflux pump  33.96 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  41.58 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  42.57 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  38 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  38 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  41.75 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  39.42 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  39 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  34.29 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  41 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  41 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  33.33 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  44.66 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  44.66 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  44.66 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  44.66 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  44.66 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  44.66 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  42.72 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  39.22 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  44.66 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  33.33 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  33.33 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>