More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1074 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1074  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 104 aa  202  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000173612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1887  sugE protein  47.12 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  39.42 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  39.42 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1391  putative multidrug resistance protein, SMR family  38.46 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.541749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  38.46 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1656  SMR family multidrug efflux pump  37.5 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0999072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  39.81 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0331  SMR family multidrug efflux pump  38.46 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40.95 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  41.9 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  40.74 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  41.51 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0108  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40.78 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  39.05 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  39.81 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0729  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.5 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00310147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.62 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  38.68 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  39.81 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  35.19 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  38.68 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0926  sugE protein, putative  37.5 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0363634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1335  multidrug resistance protein YkkD  36.17 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0742  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.5 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00206862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0833  sugE protein  37.5 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000128265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0928  putative sugE protein  37.5 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.81419e-47 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0997  putative sugE protein  37.5 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000051913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>