More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1391 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1391  putative multidrug resistance protein, SMR family  100 
 
 		 104 aa  197  3.9999999999999996e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.541749  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  87.5 
 
 		 104 aa  177  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1656  SMR family multidrug efflux pump  87.5 
 
 		 104 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0999072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0331  SMR family multidrug efflux pump  85.58 
 
 		 104 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1887  sugE protein  48.08 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  44.23 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  44.23 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  44.23 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  44.23 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  44.23 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  44.23 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  44.23 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  44.23 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  44.23 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  38.46 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  38.46 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1074  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000173612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0745  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0928  putative sugE protein  41.35 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.81419e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0926  sugE protein, putative  41.35 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0363634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0793  sugE protein  41.35 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000122325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0742  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.35 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00206862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0729  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.35 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00310147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0997  putative sugE protein  41.35 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000051913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0833  sugE protein  41.35 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000128265  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  34.58 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0108  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0888  putative sugE protein  41.35 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4446  putative sugE protein  41.35 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881234  normal  0.621575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  37.25 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  43.48 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  36.27 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  33.64 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  33.33 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  31.37 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5569  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  30.39 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.31 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  32.35 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  32.04 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  32.71 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  33.02 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  28.85 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0112  membrane transporter  31.73 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000063895  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  33.02 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3601  SugE protein  40.95 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51586  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  37.14 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  33.02 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0113  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  33.01 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>