More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1887 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1887  sugE protein  100 
 
 		 105 aa  201  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1391  putative multidrug resistance protein, SMR family  48.08 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.541749  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  47.12 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0331  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1656  SMR family multidrug efflux pump  45.19 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0999072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1074  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000173612  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  40.38 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  38.46 
 
 		 104 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  38.24 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  44.23 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  42.86 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0108  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  39.05 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.19 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40.19 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  36.11 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  41.51 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.19 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.19 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  36.11 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  36.94 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.19 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.19 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  38.83 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.19 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  42.72 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  49.21 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  36.27 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  36.19 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  36.19 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1335  multidrug resistance protein YkkD  37.23 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  38.83 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  33.64 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.26 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  43.96 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  38.32 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  35.58 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  38.83 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0113  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  37.38 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  37.38 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  35.29 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  37.38 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  37.38 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  37.38 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>