267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1335 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1335  multidrug resistance protein YkkD  100 
 
 		 106 aa  206  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0782  methionyl-tRNA formyltransferase  61.32 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1182  multidrug resistance protein YkkD  57.01 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1074  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000173612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1887  sugE protein  37.74 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  38.14 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  35.64 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  35.64 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  35.64 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  35.64 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  35.64 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  35.64 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  35.64 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1656  SMR family multidrug efflux pump  38.54 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0999072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  34.65 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  34.65 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0331  SMR family multidrug efflux pump  37.5 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  36.19 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  36.19 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  38.1 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  36.19 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  38.1 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  36.14 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  37.36 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  36.19 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  30.48 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  36.25 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  27.66 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  35.8 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  36.14 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  33.02 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  36.14 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  35.24 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  34.65 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  34.65 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  36.25 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  32.14 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  32.61 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  36.19 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  36.19 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  37.14 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  36.19 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  36.14 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  36.19 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  36.19 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  36.19 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  36.19 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  34.41 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  35.8 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  30.95 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  30.19 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  33.33 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1391  putative multidrug resistance protein, SMR family  32.99 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.541749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  30.69 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  36.14 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  33.75 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  42.62 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  29.76 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  29.52 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>