274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1182 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1182  multidrug resistance protein YkkD  100 
 
 		 108 aa  208  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1335  multidrug resistance protein YkkD  57.01 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0782  methionyl-tRNA formyltransferase  59.26 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  40.7 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  39.02 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  39.02 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.02 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.02 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.02 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  39.02 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.02 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.12 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.02 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.02 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  45.12 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.02 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  37.8 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  37.8 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  37.78 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  40.48 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  37.74 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  36.59 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  46.38 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  43.48 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  45.12 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  36.9 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.48 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1656  SMR family multidrug efflux pump  39.18 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0999072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  41.43 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  44.93 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  38.14 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  36.9 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  38.57 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0331  SMR family multidrug efflux pump  39.18 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  39.51 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  40.24 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  44.93 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  45.31 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  43.48 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  37.8 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  34.58 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  33.03 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1391  putative multidrug resistance protein, SMR family  36.45 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.541749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  36.9 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  45.9 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  36.62 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1887  sugE protein  35.51 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  43.48 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  39.02 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  36.47 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  40.48 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  40.24 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  40.19 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  40.32 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  43.75 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  40.24 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  45.9 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  31.78 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  40.48 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  38.81 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  38.57 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  45.9 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  39.44 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  32.71 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  39.02 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  39.02 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  39.02 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  36.9 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  37.8 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  40.62 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  45.16 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  37.8 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  38.1 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  31.78 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  41.54 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  33.33 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  43.08 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  33.33 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  40.62 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  34.91 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  37.8 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>