More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0782 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0782  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 107 aa  204  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1335  multidrug resistance protein YkkD  60 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1182  multidrug resistance protein YkkD  59.26 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  39.6 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  40.38 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  41.58 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1074  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000173612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1656  SMR family multidrug efflux pump  41.35 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0999072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  40.38 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  48.44 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0331  SMR family multidrug efflux pump  41.24 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  35.78 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  36.79 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  34.26 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  34.91 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.91 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.91 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.91 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  34.26 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.91 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.91 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  34.91 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.91 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1391  putative multidrug resistance protein, SMR family  50.77 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.541749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  37.96 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1887  sugE protein  37.14 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  36.19 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  45.9 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0108  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  39.81 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  33.94 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  35.05 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  39.81 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  36.26 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5569  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4015  small multidrug resistance protein  31.31 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216175  normal  0.030701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  35.92 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  42.62 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  36.54 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  42.62 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  46.03 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  34.62 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  35.64 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0758  sugE protein  40 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.748062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  34 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2190  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  37.35 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  28.57 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  28.57 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2408  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  33.65 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  39.06 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  33.33 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>