More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0112 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0112  membrane transporter  100 
 
 		 106 aa  203  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000063895  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1338  membrane transporter  52.83 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.265274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  49.06 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  47.17 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  43.27 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  43.27 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 155 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  48.6 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  43.27 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  42.45 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  48.08 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  42.31 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  42.31 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  43.69 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  47.12 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.35 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  43.69 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  48.6 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 106 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  40.38 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  40.38 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  40.38 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  40.38 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  40.38 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  40.38 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  41.35 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  40.38 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 122 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  38.24 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  39.05 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  41.58 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40.95 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>