More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4108 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
530 aa  1051    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  30.76 
 
 
525 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
516 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
510 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  24.62 
 
 
553 aa  151  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  26.58 
 
 
521 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 
521 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  30.58 
 
 
524 aa  147  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  38.02 
 
 
520 aa  140  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  29.33 
 
 
542 aa  140  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
530 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  28.05 
 
 
507 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  27.92 
 
 
507 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  28.45 
 
 
477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2147  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 
525 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148347  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  26.19 
 
 
529 aa  133  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  31.43 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  25.71 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  28.07 
 
 
506 aa  130  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  31.08 
 
 
502 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  29.86 
 
 
514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  25.66 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  31.46 
 
 
522 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  27.31 
 
 
526 aa  126  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  34.2 
 
 
505 aa  126  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  29.44 
 
 
550 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  29.67 
 
 
554 aa  124  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  25.83 
 
 
545 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  30.22 
 
 
536 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  23.51 
 
 
525 aa  119  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  24.87 
 
 
634 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  29.15 
 
 
510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  24.5 
 
 
513 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  29.08 
 
 
528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1374  apolipoprotein N-acyltransferase  25.77 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  28.06 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  35.63 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  32.14 
 
 
507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  31.44 
 
 
497 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  25.35 
 
 
560 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  23.99 
 
 
501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1405  apolipoprotein N-acyltransferase  25.51 
 
 
516 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  33.62 
 
 
505 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  29.41 
 
 
532 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  29.41 
 
 
532 aa  110  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  34.6 
 
 
552 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  28.74 
 
 
488 aa  109  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 
541 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 
504 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  25.78 
 
 
505 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0358  apolipoprotein N-acyltransferase  27.47 
 
 
505 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  34.78 
 
 
495 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  23.43 
 
 
491 aa  107  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 
536 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  27.04 
 
 
532 aa  107  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  28.92 
 
 
525 aa  106  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  23.89 
 
 
472 aa  106  9e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  25.18 
 
 
544 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.51 
 
 
503 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  33.98 
 
 
524 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.48 
 
 
495 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  23.86 
 
 
537 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  30.06 
 
 
502 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  28.4 
 
 
503 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  28.82 
 
 
534 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.56 
 
 
479 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  30.62 
 
 
567 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  28.68 
 
 
520 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  30.56 
 
 
523 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  34.29 
 
 
487 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  30.56 
 
 
523 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  32.13 
 
 
487 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  34.09 
 
 
523 aa  104  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  28.1 
 
 
500 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  29.06 
 
 
534 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  29.38 
 
 
543 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  21.72 
 
 
488 aa  103  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  24.06 
 
 
537 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  25.69 
 
 
533 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  25.48 
 
 
538 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  29.44 
 
 
556 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  30.59 
 
 
543 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  23.35 
 
 
510 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  29.15 
 
 
528 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  31.87 
 
 
495 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  30.44 
 
 
567 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 
537 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  28.75 
 
 
557 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1533  apolipoprotein N-acyltransferase  32.43 
 
 
581 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.97 
 
 
566 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  26.88 
 
 
505 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  29.86 
 
 
506 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  29.79 
 
 
521 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  33.7 
 
 
501 aa  100  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  27.4 
 
 
537 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  28.15 
 
 
534 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  29.41 
 
 
576 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  28.97 
 
 
505 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>