291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3232 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 634 aa  1290    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  31.09 
 
 		 507 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 		 521 aa  185  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  29.33 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.06 
 
 		 507 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.05 
 
 		 516 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  31.47 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  28.65 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  27.29 
 
 		 542 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  29.69 
 
 		 529 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  28.3 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  28.32 
 
 		 514 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  27.4 
 
 		 506 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  26.05 
 
 		 530 aa  144  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  27.7 
 
 		 510 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  26.86 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  27.22 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  29.24 
 
 		 522 aa  132  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  24.52 
 
 		 553 aa  128  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  26.47 
 
 		 550 aa  127  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  23.12 
 
 		 544 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2147  apolipoprotein N-acyltransferase  33.1 
 
 		 525 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  28.26 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  24.28 
 
 		 513 aa  124  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  24.82 
 
 		 526 aa  123  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  25.72 
 
 		 526 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  29.11 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  25.74 
 
 		 560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  27.93 
 
 		 541 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  24.9 
 
 		 530 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  24.3 
 
 		 519 aa  115  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 		 528 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  24.54 
 
 		 545 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  27.18 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  27.65 
 
 		 543 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  29 
 
 		 537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  30.91 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  27.42 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  28.43 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  24.81 
 
 		 524 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  28.39 
 
 		 534 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  28.1 
 
 		 505 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  26.92 
 
 		 516 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  26.67 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  26.41 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 		 520 aa  107  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  28.83 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  23.26 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  26.86 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 		 505 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  25.59 
 
 		 537 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 		 554 aa  104  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  26.96 
 
 		 534 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  30.18 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  25.19 
 
 		 501 aa  102  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1921  apolipoprotein N-acyltransferase  27.22 
 
 		 629 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0008443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09770  apolipoprotein N-acyltransferase  22.13 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  26.68 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  26.9 
 
 		 534 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  27.76 
 
 		 536 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  25.95 
 
 		 518 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1566  apolipoprotein N-acyltransferase  23.84 
 
 		 500 aa  101  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.910854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  22.85 
 
 		 525 aa  101  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 		 525 aa  101  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  27.25 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 		 528 aa  101  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  27.63 
 
 		 536 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 		 552 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  27 
 
 		 505 aa  100  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  25.29 
 
 		 504 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2709  apolipoprotein N-acyltransferase  25.73 
 
 		 604 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.77 
 
 		 495 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  26.15 
 
 		 524 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  25.87 
 
 		 512 aa  98.6  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  25.46 
 
 		 512 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  25.17 
 
 		 512 aa  99  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  27.25 
 
 		 550 aa  98.2  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  30.18 
 
 		 495 aa  98.2  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  26.97 
 
 		 566 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  25.65 
 
 		 515 aa  97.8  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  26.49 
 
 		 487 aa  97.8  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  24.6 
 
 		 506 aa  97.8  6e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  25.64 
 
 		 524 aa  97.4  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  25.9 
 
 		 524 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  24.94 
 
 		 529 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  25.64 
 
 		 512 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  26.51 
 
 		 536 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  25.93 
 
 		 512 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  25.64 
 
 		 524 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  25.18 
 
 		 509 aa  96.3  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  23.65 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  25.7 
 
 		 509 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  25.58 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  26.42 
 
 		 506 aa  96.3  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  25.24 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  25.58 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  25.17 
 
 		 532 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 		 501 aa  96.3  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  25.58 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>