More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1977 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
530 aa  1075    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  62.99 
 
 
514 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  62.33 
 
 
518 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  30.34 
 
 
521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  31.1 
 
 
525 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.2 
 
 
510 aa  213  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.71 
 
 
521 aa  209  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 
477 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  30.63 
 
 
507 aa  203  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  29.5 
 
 
507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  31.19 
 
 
516 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2147  apolipoprotein N-acyltransferase  32.88 
 
 
525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148347  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  28.97 
 
 
542 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.39 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  26.64 
 
 
553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  28.8 
 
 
529 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  28.65 
 
 
526 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  27.41 
 
 
502 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  26.04 
 
 
634 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  26.39 
 
 
510 aa  151  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  29.89 
 
 
541 aa  150  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  28.17 
 
 
526 aa  147  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  29.04 
 
 
536 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  29.87 
 
 
535 aa  146  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  25.27 
 
 
513 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  28.33 
 
 
528 aa  143  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  27.13 
 
 
497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.11 
 
 
536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 
525 aa  141  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  29.64 
 
 
590 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  27.63 
 
 
520 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  27.54 
 
 
507 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  30.61 
 
 
536 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09770  apolipoprotein N-acyltransferase  26.46 
 
 
488 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  29.47 
 
 
589 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  27.26 
 
 
554 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
522 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  28.92 
 
 
590 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  27.2 
 
 
519 aa  136  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 
545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2709  apolipoprotein N-acyltransferase  27.79 
 
 
604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  26.4 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  28.11 
 
 
536 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  28.09 
 
 
530 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  28.49 
 
 
509 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  30.02 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  30.02 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  34.17 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  25.43 
 
 
537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  26.74 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  27.85 
 
 
509 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  24.01 
 
 
544 aa  128  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  28.05 
 
 
517 aa  128  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.85 
 
 
512 aa  127  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  27.5 
 
 
514 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  25.93 
 
 
523 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  25.4 
 
 
529 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  33.82 
 
 
500 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  25.81 
 
 
506 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  25.4 
 
 
529 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  25.2 
 
 
529 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  25.2 
 
 
529 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  25.2 
 
 
529 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  26.69 
 
 
505 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  27.49 
 
 
534 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  26.53 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  26.53 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.88 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  26.53 
 
 
512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  26.69 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  26.83 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  26.83 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.43 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4463  apolipoprotein N-acyltransferase  27.13 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 
543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.09 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  26.83 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  26.53 
 
 
512 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  26.34 
 
 
512 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  26.34 
 
 
512 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  28.22 
 
 
504 aa  120  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 
509 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  29.48 
 
 
528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  27.45 
 
 
508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  27.12 
 
 
507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2199  apolipoprotein N-acyltransferase  31.08 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  26.29 
 
 
505 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  36.65 
 
 
487 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  27.83 
 
 
507 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  26.65 
 
 
506 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  28.81 
 
 
531 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  27.04 
 
 
515 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 
505 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  29.71 
 
 
534 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  29.75 
 
 
534 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  24.2 
 
 
521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  35.1 
 
 
497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>