More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0448 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  72.83 
 
 		 535 aa  781    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 536 aa  1059    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  68.53 
 
 		 536 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  81.61 
 
 		 536 aa  863    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  75.52 
 
 		 534 aa  797    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  81.97 
 
 		 536 aa  868    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  73.98 
 
 		 541 aa  793    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  52.99 
 
 		 540 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  49.18 
 
 		 567 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  50.93 
 
 		 556 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  49 
 
 		 567 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  44.32 
 
 		 557 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  50.75 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  45.26 
 
 		 532 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  49.36 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  44.69 
 
 		 532 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  48.58 
 
 		 576 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  44.49 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  46.79 
 
 		 543 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  45.38 
 
 		 550 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  44.91 
 
 		 534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  44.55 
 
 		 534 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  44.16 
 
 		 528 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  43.03 
 
 		 543 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  38.83 
 
 		 541 aa  364  3e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  40.35 
 
 		 523 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  40.35 
 
 		 523 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  37.74 
 
 		 531 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  36.12 
 
 		 537 aa  286  7e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  38.04 
 
 		 502 aa  280  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  32.49 
 
 		 501 aa  267  4e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  37.47 
 
 		 508 aa  247  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  32.03 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  36.44 
 
 		 528 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  37.76 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  35.2 
 
 		 525 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  37.63 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  36.73 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  35.66 
 
 		 472 aa  231  3e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  36.73 
 
 		 495 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  34.9 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  32.97 
 
 		 537 aa  203  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  33.02 
 
 		 522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.18 
 
 		 573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  31.3 
 
 		 516 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  31.67 
 
 		 516 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  31.25 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 		 518 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  30.94 
 
 		 588 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  30.02 
 
 		 511 aa  187  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  28.79 
 
 		 524 aa  186  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 		 509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 		 515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  31.57 
 
 		 510 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  33.62 
 
 		 506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  31.02 
 
 		 518 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  33.87 
 
 		 507 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  32.21 
 
 		 513 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  31.29 
 
 		 516 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  34.02 
 
 		 521 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  31.07 
 
 		 519 aa  179  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  30.96 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 		 523 aa  178  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 		 524 aa  178  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.39 
 
 		 509 aa  177  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  33.82 
 
 		 507 aa  177  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  32.24 
 
 		 523 aa  176  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  31.88 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  30.7 
 
 		 529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  36.39 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.1 
 
 		 510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  31.23 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  30.51 
 
 		 529 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  30.51 
 
 		 529 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  31.23 
 
 		 524 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  30.51 
 
 		 529 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 		 506 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  32.96 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  31.04 
 
 		 524 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  30.51 
 
 		 529 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  31.7 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  32.59 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.79 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  32.22 
 
 		 525 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  32.59 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  30.55 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  31.23 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  30.25 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  32.9 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  31.24 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  32.59 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  32.6 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.21 
 
 		 514 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  27.04 
 
 		 522 aa  170  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  32.61 
 
 		 509 aa  170  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  29.06 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>