More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0554 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
522 aa  1039    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  57.03 
 
 
502 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  48.45 
 
 
528 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  46.76 
 
 
552 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  44.6 
 
 
505 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  44.1 
 
 
520 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  37.95 
 
 
525 aa  289  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  37.7 
 
 
521 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  38.72 
 
 
507 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  36.55 
 
 
521 aa  282  9e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  38.77 
 
 
506 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  38.33 
 
 
507 aa  279  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  39 
 
 
477 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  36.42 
 
 
516 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  38.89 
 
 
542 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  38.27 
 
 
510 aa  256  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  35.28 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  30.89 
 
 
513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  32.84 
 
 
532 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 
479 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  34.08 
 
 
524 aa  193  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  30.75 
 
 
553 aa  193  6e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  32.56 
 
 
529 aa  193  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  34.05 
 
 
489 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  34.08 
 
 
524 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  33.73 
 
 
514 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  35.13 
 
 
528 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  32.76 
 
 
505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  31.53 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  31.59 
 
 
522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  33.47 
 
 
502 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
505 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  30.68 
 
 
523 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  34.8 
 
 
562 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  33.7 
 
 
523 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  33.7 
 
 
523 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
564 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  32.54 
 
 
510 aa  180  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  35.05 
 
 
567 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  33.96 
 
 
507 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  34.51 
 
 
562 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  37.54 
 
 
524 aa  177  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  34.52 
 
 
534 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 
507 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  34.27 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  34.3 
 
 
534 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  35.16 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  33.12 
 
 
500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  33.97 
 
 
524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 
537 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  32.19 
 
 
505 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  33.71 
 
 
503 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 
506 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  30.78 
 
 
507 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  33.06 
 
 
511 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  33.47 
 
 
511 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  32.43 
 
 
582 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  33.12 
 
 
528 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.64 
 
 
503 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  32.53 
 
 
504 aa  170  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  28.43 
 
 
492 aa  170  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  30.73 
 
 
500 aa  169  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  31.8 
 
 
536 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  30.59 
 
 
536 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  28.98 
 
 
532 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0586  apolipoprotein N-acyltransferase  32.73 
 
 
571 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  30.17 
 
 
537 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  32.68 
 
 
567 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  32.65 
 
 
506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  34.35 
 
 
567 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  32.72 
 
 
509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  34.35 
 
 
567 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  31.61 
 
 
535 aa  167  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
532 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  32.77 
 
 
541 aa  167  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
543 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  35.05 
 
 
505 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  32.89 
 
 
532 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  29.95 
 
 
518 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  29.72 
 
 
520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  38.97 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  32.67 
 
 
532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  27.25 
 
 
501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.61 
 
 
510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  27.05 
 
 
506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  33.13 
 
 
557 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0600  apolipoprotein N-acyltransferase  32.79 
 
 
553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  27.65 
 
 
515 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  27.65 
 
 
515 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  27.65 
 
 
515 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 
521 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  28.88 
 
 
511 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  30.08 
 
 
534 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  27.2 
 
 
506 aa  160  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  34.8 
 
 
509 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 
541 aa  160  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
512 aa  160  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1566  apolipoprotein N-acyltransferase  29.71 
 
 
500 aa  159  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.910854  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  28.36 
 
 
505 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  30.06 
 
 
536 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>