More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3596 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 495 aa  946    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  84.44 
 
 		 495 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  98.18 
 
 		 495 aa  930    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  51.45 
 
 		 497 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  46.49 
 
 		 487 aa  341  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  42.42 
 
 		 508 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  42.54 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  38.82 
 
 		 541 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  39.13 
 
 		 536 aa  263  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  38.64 
 
 		 535 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  37.43 
 
 		 534 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  38.8 
 
 		 528 aa  256  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  37.48 
 
 		 534 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  39.3 
 
 		 543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  37.94 
 
 		 536 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  36.08 
 
 		 534 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  39.21 
 
 		 532 aa  247  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  38.2 
 
 		 536 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  36.49 
 
 		 532 aa  246  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  36.29 
 
 		 532 aa  244  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  39.8 
 
 		 523 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  39.8 
 
 		 523 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  34.87 
 
 		 541 aa  243  5e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  39.11 
 
 		 567 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  39.11 
 
 		 567 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  36.78 
 
 		 536 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  38.59 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  39.05 
 
 		 525 aa  230  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  38.85 
 
 		 556 aa  226  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  37.97 
 
 		 550 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  38.72 
 
 		 566 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  37.37 
 
 		 540 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  38.56 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  37.87 
 
 		 576 aa  220  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  38.59 
 
 		 528 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  35.69 
 
 		 588 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  30.48 
 
 		 472 aa  216  9e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  39.19 
 
 		 531 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  39.25 
 
 		 502 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  38.24 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  34.7 
 
 		 507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  34.33 
 
 		 507 aa  196  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 		 516 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  32.01 
 
 		 518 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  32.82 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  31.67 
 
 		 501 aa  193  5e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.7 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  32.38 
 
 		 537 aa  192  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  30.54 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  29.15 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  32.24 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  30.23 
 
 		 524 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 		 524 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 		 519 aa  186  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.6 
 
 		 518 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  30.89 
 
 		 524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 		 524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  30.43 
 
 		 524 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  28.34 
 
 		 524 aa  184  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  34.45 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 		 525 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.78 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  29.3 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  34.14 
 
 		 522 aa  180  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  31.64 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31.32 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  31.91 
 
 		 542 aa  177  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  29.62 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  31.85 
 
 		 520 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  34.15 
 
 		 477 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  32.67 
 
 		 509 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  32.8 
 
 		 506 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  33.75 
 
 		 506 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  31.16 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  34.25 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  32.21 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  30.29 
 
 		 541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 		 501 aa  173  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  29.72 
 
 		 506 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  33.53 
 
 		 506 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  32.93 
 
 		 507 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  33.63 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 		 487 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  29.17 
 
 		 524 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.51 
 
 		 509 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  30.98 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  33.84 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  33.62 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 		 529 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 		 529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 		 529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 		 529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  28.13 
 
 		 522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  35.06 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  32.93 
 
 		 510 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>