More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3128 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
529 aa  1079    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  35.53 
 
 
521 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 
542 aa  279  8e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  35.73 
 
 
507 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  35.31 
 
 
521 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  35.94 
 
 
516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  35.33 
 
 
507 aa  266  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  36.54 
 
 
477 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  34.1 
 
 
525 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  33.53 
 
 
510 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  34.79 
 
 
506 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  31.2 
 
 
553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  31.02 
 
 
526 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 
502 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  33.57 
 
 
522 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  32.1 
 
 
528 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  32.08 
 
 
505 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  30.58 
 
 
526 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 
537 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.4 
 
 
537 aa  183  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  33.86 
 
 
524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  32.16 
 
 
528 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  31.24 
 
 
520 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  31.13 
 
 
535 aa  177  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  30.44 
 
 
507 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  29.45 
 
 
513 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  31.61 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  30.35 
 
 
634 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  31.74 
 
 
534 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
537 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 
509 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  29.7 
 
 
536 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
560 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  32.15 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 
501 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  30.29 
 
 
534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  31.54 
 
 
532 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  31.89 
 
 
500 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 
536 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  30.46 
 
 
536 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  30.14 
 
 
506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.61 
 
 
524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  30.84 
 
 
534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  26.04 
 
 
523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  29.28 
 
 
514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  29.55 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  29.28 
 
 
536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  28.37 
 
 
488 aa  164  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  26.81 
 
 
524 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  31 
 
 
532 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  28.24 
 
 
518 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  31.87 
 
 
552 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  28.41 
 
 
537 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  30.79 
 
 
489 aa  161  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 
523 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 
523 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  29.42 
 
 
514 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  30.6 
 
 
505 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  27.22 
 
 
510 aa  160  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  32.27 
 
 
487 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  28.73 
 
 
506 aa  160  6e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  26.24 
 
 
537 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  28.27 
 
 
530 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 
515 aa  160  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 
515 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  27.44 
 
 
522 aa  160  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 
515 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  28.4 
 
 
519 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  30.23 
 
 
516 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  34.75 
 
 
505 aa  156  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  29.8 
 
 
541 aa  156  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.19 
 
 
479 aa  156  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  30.64 
 
 
557 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2147  apolipoprotein N-acyltransferase  30.43 
 
 
525 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148347  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  25.9 
 
 
472 aa  155  2e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  29.56 
 
 
515 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
516 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  30.62 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  32.56 
 
 
507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  27.67 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  28.73 
 
 
512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
541 aa  154  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  28.37 
 
 
505 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  28.37 
 
 
505 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  28.16 
 
 
518 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  30.49 
 
 
519 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.49 
 
 
518 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  28.45 
 
 
520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  29.88 
 
 
509 aa  153  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  30.24 
 
 
553 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  30.08 
 
 
556 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 
550 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  26.6 
 
 
501 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.28 
 
 
566 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  26.57 
 
 
554 aa  151  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 
509 aa  151  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  32.45 
 
 
531 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0358  apolipoprotein N-acyltransferase  29.25 
 
 
505 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
505 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>