More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0442 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 528 aa  1051    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  61.42 
 
 		 534 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  61.8 
 
 		 534 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  57.82 
 
 		 543 aa  595  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  55.11 
 
 		 532 aa  551  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  55.3 
 
 		 532 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  55.45 
 
 		 532 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  45.68 
 
 		 541 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  45.73 
 
 		 543 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  44.11 
 
 		 535 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  42.64 
 
 		 534 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  43.09 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  43.18 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  44.66 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  43.77 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  43.02 
 
 		 536 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  41.57 
 
 		 536 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  45.47 
 
 		 556 aa  363  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  43.04 
 
 		 540 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  41.79 
 
 		 550 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  40.8 
 
 		 576 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  46.65 
 
 		 567 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  46.65 
 
 		 567 aa  350  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  47.08 
 
 		 553 aa  347  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  45.99 
 
 		 566 aa  332  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  37.94 
 
 		 523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  37.94 
 
 		 523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  37.89 
 
 		 531 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  38.1 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  36.48 
 
 		 537 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  36.59 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  38.8 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  38.53 
 
 		 502 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  38.55 
 
 		 495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  37.41 
 
 		 495 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  31.6 
 
 		 488 aa  224  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  34.91 
 
 		 508 aa  223  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  31.91 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  33.08 
 
 		 516 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  35.82 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  33.47 
 
 		 525 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  30.42 
 
 		 510 aa  196  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  29.33 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  34.65 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.83 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.83 
 
 		 507 aa  193  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  30.23 
 
 		 501 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  34.74 
 
 		 506 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  32.38 
 
 		 502 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 		 524 aa  190  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 		 521 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  30.92 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  35.13 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  34.44 
 
 		 528 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 		 500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  34.44 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  32.46 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  32.91 
 
 		 588 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  33.8 
 
 		 511 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  34.12 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  33.48 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  34.33 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 		 542 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  30.64 
 
 		 524 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  33.18 
 
 		 520 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  31.46 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  32.26 
 
 		 492 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  30.85 
 
 		 524 aa  179  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.52 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  29.94 
 
 		 518 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  33.67 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  33.9 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  32.71 
 
 		 505 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  31.64 
 
 		 529 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  30.4 
 
 		 521 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  32.37 
 
 		 505 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.32 
 
 		 509 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  32.2 
 
 		 507 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 		 515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 		 515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  33 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 		 515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.49 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  31.2 
 
 		 504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  32.16 
 
 		 505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 		 522 aa  174  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 		 514 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  31.06 
 
 		 504 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  30.58 
 
 		 537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  29.45 
 
 		 516 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 		 532 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  31.65 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31.04 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  31.85 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  30.79 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  33.64 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 		 509 aa  171  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>