More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3876 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  84.44 
 
 
495 aa  740    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  85.25 
 
 
495 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  954    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  51.98 
 
 
497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  46.83 
 
 
487 aa  345  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  42.42 
 
 
508 aa  307  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  38.45 
 
 
536 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  40.13 
 
 
557 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  37.8 
 
 
541 aa  250  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  37.73 
 
 
534 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  36.84 
 
 
535 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  36.29 
 
 
534 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  37.42 
 
 
543 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  39.24 
 
 
523 aa  242  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  39.24 
 
 
523 aa  242  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  37.41 
 
 
528 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  35.66 
 
 
534 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  36.06 
 
 
536 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  36.88 
 
 
536 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  36.62 
 
 
536 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  36.12 
 
 
532 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  37.96 
 
 
567 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  35.91 
 
 
532 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  38.16 
 
 
567 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  33.7 
 
 
541 aa  232  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  37.27 
 
 
532 aa  230  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  37.88 
 
 
543 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  38.27 
 
 
556 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  39.26 
 
 
537 aa  226  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  38.7 
 
 
525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  37.99 
 
 
540 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  38.24 
 
 
528 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  38.22 
 
 
566 aa  216  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  39.61 
 
 
531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  31.1 
 
 
472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  37.57 
 
 
550 aa  213  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  35.73 
 
 
576 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  36.02 
 
 
588 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  38.43 
 
 
553 aa  207  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  36.55 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  31.74 
 
 
523 aa  194  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  34.19 
 
 
507 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  33.76 
 
 
507 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.98 
 
 
518 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  32.64 
 
 
505 aa  183  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 
524 aa  182  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
524 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.43 
 
 
510 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  32.01 
 
 
511 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  31.69 
 
 
542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  29.87 
 
 
516 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.6 
 
 
516 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  29.48 
 
 
519 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  32.35 
 
 
525 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  31.2 
 
 
492 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  29.71 
 
 
516 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.67 
 
 
537 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  33.2 
 
 
506 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  28.04 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  29.76 
 
 
501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  32.8 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  31.63 
 
 
521 aa  174  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  32.26 
 
 
509 aa  174  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  29.75 
 
 
522 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.21 
 
 
518 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  30.49 
 
 
524 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  30.12 
 
 
524 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  30.5 
 
 
524 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  34.69 
 
 
522 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.77 
 
 
509 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
524 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 
509 aa  170  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 
501 aa  170  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
512 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  32.39 
 
 
515 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  30.63 
 
 
519 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  34.33 
 
 
477 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
506 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.36 
 
 
514 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  28.81 
 
 
524 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  32.49 
 
 
505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  35.63 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.95 
 
 
509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  33.73 
 
 
507 aa  163  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  29.51 
 
 
529 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  29.51 
 
 
529 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 
479 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  29.51 
 
 
529 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  29.51 
 
 
529 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  32.34 
 
 
506 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  29.32 
 
 
529 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  33.2 
 
 
510 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  32.23 
 
 
528 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  33.05 
 
 
524 aa  159  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>