More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1013 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 497 aa  944    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  52.55 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  52.61 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  53.03 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  49.54 
 
 		 487 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  42.45 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  37.68 
 
 		 536 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  37.67 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  37.79 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  38 
 
 		 536 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  39.56 
 
 		 557 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  36.71 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  36.47 
 
 		 534 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  35.92 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  36.4 
 
 		 536 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  35.73 
 
 		 532 aa  230  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  38.49 
 
 		 531 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  38.98 
 
 		 532 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  32.42 
 
 		 541 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  37.27 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  36.33 
 
 		 537 aa  213  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  37.91 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  38.81 
 
 		 523 aa  209  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  38.81 
 
 		 523 aa  209  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  36.27 
 
 		 543 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  37.39 
 
 		 502 aa  207  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  36.65 
 
 		 534 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  36.34 
 
 		 534 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  35.4 
 
 		 576 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  34.85 
 
 		 528 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  35.19 
 
 		 522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  35.26 
 
 		 588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  29.07 
 
 		 472 aa  200  5e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  34.32 
 
 		 573 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  34.18 
 
 		 525 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  34.79 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  37.15 
 
 		 543 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  35.58 
 
 		 567 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 		 488 aa  176  9e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  35.38 
 
 		 567 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.05 
 
 		 510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  32.45 
 
 		 525 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.82 
 
 		 479 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  30.39 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.76 
 
 		 507 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  36.5 
 
 		 556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  34.64 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  35.18 
 
 		 566 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.9 
 
 		 507 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  32.87 
 
 		 521 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 542 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  34.2 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  31.45 
 
 		 492 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  35.61 
 
 		 553 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  32.16 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.14 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  31.77 
 
 		 507 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  27.89 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  32.97 
 
 		 520 aa  156  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.16 
 
 		 509 aa  156  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  32.92 
 
 		 521 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.98 
 
 		 509 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  31.51 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  30.16 
 
 		 515 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  30.16 
 
 		 515 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  30.16 
 
 		 515 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  32.04 
 
 		 505 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  31.04 
 
 		 520 aa  152  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  31.46 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  32.86 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  31.72 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  29.84 
 
 		 506 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  31.45 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  30.49 
 
 		 505 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.98 
 
 		 477 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  33.42 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  32.32 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  29.09 
 
 		 523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  30.5 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  30.86 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  28.26 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  33.54 
 
 		 507 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 		 497 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  30.6 
 
 		 512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  30.96 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 		 529 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  30.98 
 
 		 509 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 		 529 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 		 529 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  30.25 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 		 529 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 		 529 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  30.25 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  29.15 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  30.4 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  26.78 
 
 		 513 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>