More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3951 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 523 aa  1029    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 523 aa  1029    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  41.28 
 
 		 557 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  42.43 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  40.71 
 
 		 535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  41.44 
 
 		 536 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  40.32 
 
 		 536 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  40.31 
 
 		 534 aa  296  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  40.35 
 
 		 536 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  40.12 
 
 		 536 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  43.49 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  38.89 
 
 		 534 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  39.84 
 
 		 540 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  39.77 
 
 		 556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  38.52 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  38.02 
 
 		 534 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  39.73 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  42.34 
 
 		 567 aa  258  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  42.34 
 
 		 567 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  39.38 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  38.39 
 
 		 537 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  37.35 
 
 		 532 aa  253  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  37.94 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  37.2 
 
 		 532 aa  252  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  37.01 
 
 		 532 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  36.38 
 
 		 550 aa  250  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  44.35 
 
 		 566 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  36.35 
 
 		 588 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  37.66 
 
 		 576 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  38.97 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  37.92 
 
 		 508 aa  239  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  32.35 
 
 		 541 aa  239  8e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  37.33 
 
 		 522 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  37.32 
 
 		 489 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  37.33 
 
 		 525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  36.94 
 
 		 524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  39.08 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  36.69 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  35.64 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  40.74 
 
 		 495 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  32.53 
 
 		 523 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  32.11 
 
 		 501 aa  228  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  34.9 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  40.58 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  37.74 
 
 		 505 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  33.8 
 
 		 518 aa  224  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  34.81 
 
 		 519 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  34.65 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  34.82 
 
 		 516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  34.93 
 
 		 507 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  37.91 
 
 		 528 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  34.07 
 
 		 506 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  36.35 
 
 		 573 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  35.79 
 
 		 479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  32.66 
 
 		 492 aa  217  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  35.57 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  33.07 
 
 		 506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  33.14 
 
 		 516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  32.72 
 
 		 497 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 515 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 515 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 515 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 510 aa  213  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  30.97 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  36.69 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  31.52 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  31.98 
 
 		 514 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  35.07 
 
 		 509 aa  210  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 		 524 aa  209  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  33.2 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  34.84 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  32.16 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  31.8 
 
 		 519 aa  207  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  35.09 
 
 		 505 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  32.73 
 
 		 506 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  32.11 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  32.77 
 
 		 505 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  34.35 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  33.74 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  33.53 
 
 		 497 aa  203  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  33.2 
 
 		 511 aa  203  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  34.55 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  37.37 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 		 506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  32.25 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  31.54 
 
 		 515 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  31.85 
 
 		 520 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  33.82 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  33.87 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  32.72 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  30.92 
 
 		 537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  32.34 
 
 		 524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  31.94 
 
 		 524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  33.14 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  33.14 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  34.69 
 
 		 505 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  34.76 
 
 		 503 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>