More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0231 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  85.97 
 
 
553 aa  844    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
556 aa  1066    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  67.4 
 
 
567 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  66.85 
 
 
567 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  62.99 
 
 
543 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  65.59 
 
 
566 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  55.49 
 
 
576 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  50.93 
 
 
536 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  51.41 
 
 
536 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  49.8 
 
 
541 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  47.88 
 
 
535 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  50.28 
 
 
536 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  49.08 
 
 
536 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  50.46 
 
 
550 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  50.86 
 
 
540 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  47.7 
 
 
534 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  46.62 
 
 
557 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  46.73 
 
 
532 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  46.93 
 
 
532 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  45.74 
 
 
532 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  45.32 
 
 
528 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  44.65 
 
 
543 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  43.44 
 
 
534 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  44.81 
 
 
534 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  37.47 
 
 
541 aa  318  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  41.02 
 
 
523 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  41.02 
 
 
523 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  39.18 
 
 
531 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  38.07 
 
 
537 aa  263  8.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  38.28 
 
 
525 aa  257  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  38.46 
 
 
502 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  38.51 
 
 
495 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  39.36 
 
 
495 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  38.97 
 
 
495 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  28.43 
 
 
488 aa  216  9e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  31.14 
 
 
472 aa  213  7e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  36.27 
 
 
528 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  32.33 
 
 
542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.96 
 
 
516 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.82 
 
 
507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  36.02 
 
 
487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  33.21 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  31.24 
 
 
523 aa  184  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  33.42 
 
 
521 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  38.02 
 
 
524 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 
515 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 
515 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 
515 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  34.68 
 
 
508 aa  180  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  32.46 
 
 
503 aa  179  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  32.73 
 
 
503 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  33.08 
 
 
507 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  34 
 
 
525 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  33.75 
 
 
532 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 
509 aa  174  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
506 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
521 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 
512 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 
512 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  31.05 
 
 
567 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  28.65 
 
 
522 aa  171  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  32.36 
 
 
511 aa  170  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  31.47 
 
 
512 aa  170  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  33.49 
 
 
489 aa  170  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  32.77 
 
 
509 aa  170  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  30.97 
 
 
562 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  32.48 
 
 
529 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  30.63 
 
 
537 aa  169  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
512 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  32.73 
 
 
523 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 
512 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  31.29 
 
 
512 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  30.57 
 
 
516 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.56 
 
 
510 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 
524 aa  168  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  30.39 
 
 
516 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  35.23 
 
 
497 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  32.53 
 
 
529 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  32.28 
 
 
529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  36.29 
 
 
588 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  32.28 
 
 
529 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  32.28 
 
 
529 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
512 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  32.1 
 
 
509 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  29.6 
 
 
518 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  29.88 
 
 
524 aa  167  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  34.13 
 
 
522 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  30.78 
 
 
519 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  29.64 
 
 
520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  31.5 
 
 
515 aa  163  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  31.52 
 
 
487 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  27.94 
 
 
501 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  29.08 
 
 
518 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.06 
 
 
519 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  30.69 
 
 
524 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  32.34 
 
 
521 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.8 
 
 
510 aa  158  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  34.61 
 
 
524 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  30.83 
 
 
512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>