More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1001 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  66.6 
 
 
521 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
507 aa  1016    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  97.44 
 
 
507 aa  975    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  64.06 
 
 
521 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  63.74 
 
 
477 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  55.51 
 
 
516 aa  527  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  54.12 
 
 
525 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  51.24 
 
 
506 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  43.88 
 
 
542 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  43.33 
 
 
510 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  39.01 
 
 
522 aa  286  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  36.69 
 
 
526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  38.1 
 
 
502 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  37.36 
 
 
505 aa  270  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  35.92 
 
 
529 aa  267  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  37.95 
 
 
520 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  35.73 
 
 
528 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 
504 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  32.23 
 
 
553 aa  233  9e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31.47 
 
 
510 aa  232  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  37.62 
 
 
479 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  34 
 
 
513 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  35.76 
 
 
520 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  37.57 
 
 
524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 
554 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  32.55 
 
 
505 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  31.53 
 
 
545 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  34.54 
 
 
552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  29.93 
 
 
537 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  32.37 
 
 
532 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  29.59 
 
 
501 aa  210  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  32.68 
 
 
519 aa  209  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  30.9 
 
 
560 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  33.79 
 
 
500 aa  209  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  32.02 
 
 
509 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.91 
 
 
514 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.32 
 
 
537 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 
504 aa  206  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  32.6 
 
 
516 aa  206  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  34.22 
 
 
507 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 
503 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  31.06 
 
 
509 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.62 
 
 
509 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  32.26 
 
 
511 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  32.6 
 
 
516 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  33.53 
 
 
519 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  34.91 
 
 
521 aa  204  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  30.63 
 
 
523 aa  204  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  31.52 
 
 
497 aa  203  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.63 
 
 
503 aa  203  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
532 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  33.83 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.2 
 
 
509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  30.89 
 
 
519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  34.12 
 
 
505 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  34.33 
 
 
505 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  33.54 
 
 
523 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  33.54 
 
 
523 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  29.22 
 
 
492 aa  200  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 
512 aa  199  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 
512 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  29.9 
 
 
530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  32.08 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  32.62 
 
 
532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  31.01 
 
 
497 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 
518 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  31.76 
 
 
514 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  31.47 
 
 
511 aa  196  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  30.86 
 
 
515 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  30.86 
 
 
515 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  30.86 
 
 
515 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 
512 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  32.6 
 
 
634 aa  195  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  31.87 
 
 
489 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
529 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  31.97 
 
 
506 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  28.92 
 
 
524 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  32.79 
 
 
535 aa  194  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
529 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  32.86 
 
 
515 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
529 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
529 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  29.69 
 
 
524 aa  194  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  32.83 
 
 
528 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
529 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  33.03 
 
 
534 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  32.62 
 
 
532 aa  193  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  31.66 
 
 
550 aa  193  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  33.13 
 
 
536 aa  193  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  32.15 
 
 
507 aa  193  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  31.12 
 
 
512 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  33.71 
 
 
523 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  32.77 
 
 
541 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>