More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1193 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  68.82 
 
 
512 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  68.82 
 
 
512 aa  732    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
509 aa  1028    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  69.02 
 
 
512 aa  733    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  68.9 
 
 
508 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  67.84 
 
 
529 aa  737    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  67.84 
 
 
529 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  69.02 
 
 
512 aa  733    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  69.02 
 
 
512 aa  731    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  71.43 
 
 
515 aa  761    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  73.19 
 
 
511 aa  766    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  71.43 
 
 
515 aa  761    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  67.84 
 
 
529 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  71.43 
 
 
515 aa  761    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  68.43 
 
 
512 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  68.82 
 
 
512 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  71.32 
 
 
509 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  67.84 
 
 
529 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  69.02 
 
 
512 aa  733    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  67.84 
 
 
529 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  94.11 
 
 
509 aa  984    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  76.23 
 
 
509 aa  798    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  68.43 
 
 
512 aa  723    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  56.21 
 
 
506 aa  583  1.0000000000000001e-165  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  49.8 
 
 
501 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  47.55 
 
 
505 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  48.56 
 
 
506 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  46.77 
 
 
492 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  43.58 
 
 
510 aa  413  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  45.44 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  42.37 
 
 
497 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  44.69 
 
 
515 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  46.95 
 
 
518 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  43.64 
 
 
519 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  44.4 
 
 
504 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  43.55 
 
 
511 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  45.74 
 
 
516 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  45.15 
 
 
516 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  45.56 
 
 
519 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  44.23 
 
 
541 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  42.16 
 
 
537 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  45.66 
 
 
520 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  45.87 
 
 
511 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  45.21 
 
 
524 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  45.01 
 
 
524 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  45.21 
 
 
524 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  40.08 
 
 
532 aa  363  5.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  45.21 
 
 
524 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  41.77 
 
 
524 aa  362  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  40.66 
 
 
514 aa  336  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  40.56 
 
 
507 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  40.61 
 
 
506 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  41.12 
 
 
507 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  40.28 
 
 
506 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  39.84 
 
 
505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  39.84 
 
 
505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  39.84 
 
 
505 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  37.26 
 
 
521 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  40.45 
 
 
505 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  40.04 
 
 
489 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  38.68 
 
 
504 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  37.7 
 
 
497 aa  300  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  38.99 
 
 
520 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  36.84 
 
 
507 aa  297  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  38.25 
 
 
479 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  37.85 
 
 
503 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  38.51 
 
 
523 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  38.03 
 
 
511 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  37.85 
 
 
503 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  38.74 
 
 
505 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  37.26 
 
 
511 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09030  apolipoprotein N-acyltransferase  40.8 
 
 
516 aa  283  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  37.12 
 
 
524 aa  279  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  36.4 
 
 
505 aa  279  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  35.18 
 
 
521 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  35.42 
 
 
500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  37.42 
 
 
500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  36.83 
 
 
487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  37.06 
 
 
523 aa  274  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  37.11 
 
 
524 aa  273  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  35.93 
 
 
485 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  36.4 
 
 
524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0678  apolipoprotein N-acyltransferase  35.52 
 
 
485 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  36.84 
 
 
510 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  34.44 
 
 
509 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  38.5 
 
 
510 aa  264  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  36.01 
 
 
522 aa  259  8e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  36.18 
 
 
509 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  33.52 
 
 
567 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  33.77 
 
 
562 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  34.45 
 
 
567 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  34.12 
 
 
562 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  33.92 
 
 
562 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1303  hypothetical protein  31.97 
 
 
511 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1302  hypothetical protein  31.31 
 
 
511 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  32.81 
 
 
564 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  32.85 
 
 
582 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0477  apolipoprotein N-acyltransferase  30.88 
 
 
488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  32.78 
 
 
567 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  32.78 
 
 
567 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>