More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0472 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  73.45 
 
 		 535 aa  788    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  75.52 
 
 		 536 aa  794    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  76.32 
 
 		 536 aa  800    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 534 aa  1055    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  78.88 
 
 		 536 aa  833    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  74.81 
 
 		 541 aa  803    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  71.46 
 
 		 536 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  49.12 
 
 		 540 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  50.46 
 
 		 567 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  50.09 
 
 		 567 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  47.7 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  44.07 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  45.61 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  44.07 
 
 		 532 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  49.54 
 
 		 566 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  44.26 
 
 		 532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  45.07 
 
 		 534 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  45.07 
 
 		 534 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  45.45 
 
 		 576 aa  399  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  46.89 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  45.83 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  42.34 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  42.64 
 
 		 528 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  42.2 
 
 		 543 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  38.51 
 
 		 541 aa  356  5e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  40.31 
 
 		 523 aa  292  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  40.31 
 
 		 523 aa  292  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  37.32 
 
 		 531 aa  281  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  36.38 
 
 		 537 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  36.44 
 
 		 502 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  34.15 
 
 		 488 aa  265  2e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  33.59 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  36.29 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  37.23 
 
 		 495 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  36.38 
 
 		 495 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  37.3 
 
 		 495 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  35.37 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  37.2 
 
 		 508 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  34.75 
 
 		 497 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  36.15 
 
 		 487 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  35.4 
 
 		 525 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 		 573 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  33.56 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.75 
 
 		 507 aa  194  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  32.05 
 
 		 588 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  30.25 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.54 
 
 		 510 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  32.5 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  32.21 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  31.84 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  32.66 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  28.69 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.7 
 
 		 509 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  30.99 
 
 		 511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  31.63 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  30.57 
 
 		 513 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  31.29 
 
 		 542 aa  180  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  31.47 
 
 		 515 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  32.56 
 
 		 525 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.25 
 
 		 477 aa  178  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.48 
 
 		 518 aa  177  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  31 
 
 		 512 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  32.2 
 
 		 509 aa  177  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  33.2 
 
 		 523 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  30.62 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  29 
 
 		 523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  30.51 
 
 		 524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  28.23 
 
 		 524 aa  174  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  30.6 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 		 519 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 		 514 aa  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 		 515 aa  172  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 		 515 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 		 515 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  29.45 
 
 		 553 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.51 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  30.49 
 
 		 529 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  33.13 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  30.47 
 
 		 524 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.32 
 
 		 503 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  30.84 
 
 		 503 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 		 509 aa  170  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  29.93 
 
 		 524 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 		 529 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  29.65 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  28.74 
 
 		 497 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  30.61 
 
 		 519 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  27.79 
 
 		 522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  28.49 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  29.33 
 
 		 529 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  32 
 
 		 562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  34.93 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  28.09 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  31.81 
 
 		 562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>