More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3208 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  98.94 
 
 		 567 aa  1080    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 567 aa  1086    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  66.85 
 
 		 556 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  92.04 
 
 		 566 aa  911    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  68.55 
 
 		 543 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  66.91 
 
 		 553 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  54.84 
 
 		 576 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  50.83 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  49 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  50.86 
 
 		 541 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  50.09 
 
 		 534 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  48.06 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  52.79 
 
 		 550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  50.47 
 
 		 536 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  48.81 
 
 		 536 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  48.31 
 
 		 540 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  48.61 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  47.15 
 
 		 532 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  47.35 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  47.29 
 
 		 532 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  46.85 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  46.39 
 
 		 534 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  44.29 
 
 		 534 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  43.95 
 
 		 543 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  35.57 
 
 		 541 aa  320  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  39.7 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  40.77 
 
 		 523 aa  273  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  40.77 
 
 		 523 aa  273  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  38.63 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  38.74 
 
 		 531 aa  243  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  38.79 
 
 		 495 aa  241  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  38.79 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  38.62 
 
 		 502 aa  236  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  38.75 
 
 		 495 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  37.76 
 
 		 528 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 		 501 aa  221  3e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  29.62 
 
 		 488 aa  220  6e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  28.74 
 
 		 472 aa  218  2.9999999999999998e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  36.16 
 
 		 508 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  31.07 
 
 		 516 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  32.71 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.01 
 
 		 537 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  33.96 
 
 		 487 aa  179  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 		 523 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.24 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  35.27 
 
 		 573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  34.19 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.24 
 
 		 509 aa  173  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  32.79 
 
 		 542 aa  170  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  33.93 
 
 		 503 aa  170  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  34.81 
 
 		 497 aa  169  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  31.64 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.47 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 		 524 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  32.25 
 
 		 509 aa  167  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 		 524 aa  167  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  30.78 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  30.78 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  30.78 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  34.1 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.73 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  31.63 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  29.75 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  34.19 
 
 		 510 aa  164  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  33.81 
 
 		 532 aa  164  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  30.51 
 
 		 506 aa  164  6e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 		 512 aa  163  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  30.69 
 
 		 516 aa  163  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  34.3 
 
 		 524 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  36.43 
 
 		 588 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 		 487 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  31.63 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  31.44 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  33.74 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  29.91 
 
 		 501 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  30.32 
 
 		 516 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 		 506 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  30.74 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  29.19 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  29.71 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.6 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  35.23 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  32.6 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  30.47 
 
 		 519 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  28.42 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.03 
 
 		 519 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  36.18 
 
 		 502 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  32.45 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 		 518 aa  157  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  30.7 
 
 		 524 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 		 553 aa  156  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  31.78 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  28.28 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  32.97 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  32.32 
 
 		 489 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>