More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1236 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
506 aa  1016    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  50.69 
 
 
521 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  50.81 
 
 
521 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  50 
 
 
507 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  51.24 
 
 
507 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  52.7 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  49.6 
 
 
525 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  48.3 
 
 
516 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  41.93 
 
 
542 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  39.59 
 
 
510 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  39.7 
 
 
522 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  40.78 
 
 
505 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  37.95 
 
 
520 aa  246  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  37.77 
 
 
502 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  39.01 
 
 
528 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  34.15 
 
 
526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  35.71 
 
 
552 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  34.42 
 
 
529 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  32.38 
 
 
513 aa  216  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  34.48 
 
 
500 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2709  apolipoprotein N-acyltransferase  36.29 
 
 
604 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31.95 
 
 
510 aa  207  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 
554 aa  206  9e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  33.19 
 
 
522 aa  206  9e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  36.4 
 
 
505 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  31.86 
 
 
523 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  36.64 
 
 
505 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  34.56 
 
 
520 aa  204  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  34.72 
 
 
479 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  31.64 
 
 
524 aa  202  9e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  36.73 
 
 
505 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  32.26 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  31.88 
 
 
512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  31.87 
 
 
512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  32.53 
 
 
524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  31.87 
 
 
512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  33.54 
 
 
589 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  33.83 
 
 
541 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 
512 aa  200  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  31.54 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.63 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  37.38 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  32.94 
 
 
504 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  33.8 
 
 
507 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 
521 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  35.51 
 
 
506 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.16 
 
 
509 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 
535 aa  196  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 
537 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  32.88 
 
 
509 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  34.11 
 
 
590 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  31.74 
 
 
529 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 
529 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  35.32 
 
 
505 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  32.5 
 
 
529 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 
529 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  35.6 
 
 
536 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  31.74 
 
 
529 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  33.11 
 
 
536 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  32.12 
 
 
510 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  34.74 
 
 
528 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 
514 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  30.98 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 
518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 
537 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  32.5 
 
 
512 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  32.52 
 
 
534 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  32.81 
 
 
508 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  33.89 
 
 
590 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  34.25 
 
 
506 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  37.6 
 
 
524 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  31.78 
 
 
516 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  31.78 
 
 
516 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  30.24 
 
 
475 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  31.69 
 
 
503 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  29.66 
 
 
519 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 
504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0601  apolipoprotein N-acyltransferase  35.75 
 
 
501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.180307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  30.47 
 
 
520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.07 
 
 
519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0752  apolipoprotein N-acyltransferase  35.75 
 
 
506 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  29.89 
 
 
505 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  32.57 
 
 
505 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  32.15 
 
 
503 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  32.2 
 
 
511 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
515 aa  183  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  33.41 
 
 
536 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  29.54 
 
 
526 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.59 
 
 
518 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  31.22 
 
 
497 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 
511 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  36.26 
 
 
511 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  29.88 
 
 
509 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  33.49 
 
 
507 aa  181  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>