More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1868 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
505 aa  1012    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  49.05 
 
 
520 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  44.47 
 
 
502 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  45.71 
 
 
522 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  44.51 
 
 
528 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  38.45 
 
 
521 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  38.23 
 
 
477 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  37.28 
 
 
525 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  39.2 
 
 
552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  36.92 
 
 
542 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  38.74 
 
 
510 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  37.64 
 
 
521 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  38.17 
 
 
507 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  37.72 
 
 
507 aa  264  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  41 
 
 
506 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  37.74 
 
 
516 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  34.3 
 
 
526 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  33.62 
 
 
509 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  34.62 
 
 
515 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  34.62 
 
 
515 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  34.62 
 
 
515 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  33.19 
 
 
509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  33.48 
 
 
529 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  33.48 
 
 
529 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  33.48 
 
 
529 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  33.48 
 
 
529 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 
529 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  35.7 
 
 
489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  33.8 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  31.57 
 
 
524 aa  197  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  31.99 
 
 
524 aa  197  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  35.62 
 
 
509 aa  197  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  33.47 
 
 
507 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  35.88 
 
 
523 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  35.88 
 
 
523 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 
537 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  33.91 
 
 
511 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  31.38 
 
 
518 aa  193  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  32.08 
 
 
529 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  31.91 
 
 
522 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 
511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  31.45 
 
 
520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  35.78 
 
 
507 aa  191  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  31.38 
 
 
523 aa  190  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  33.2 
 
 
506 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  32.98 
 
 
509 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  35.57 
 
 
505 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  35.33 
 
 
532 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  33.47 
 
 
506 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
512 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  32.8 
 
 
514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  34.78 
 
 
507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.8 
 
 
479 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
513 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  34.09 
 
 
503 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.94 
 
 
503 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 
541 aa  183  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 
512 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  30.92 
 
 
512 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  30.92 
 
 
512 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  31.42 
 
 
512 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  32.46 
 
 
492 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  34.77 
 
 
523 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  31.73 
 
 
504 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  31.42 
 
 
512 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  36.75 
 
 
510 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  32.63 
 
 
512 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
510 aa  180  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  35.18 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  32.06 
 
 
500 aa  179  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  34.49 
 
 
510 aa  180  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  34.81 
 
 
505 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 
519 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
505 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  36.01 
 
 
524 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  32.54 
 
 
506 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  31.35 
 
 
512 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
504 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  33.91 
 
 
505 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  31.96 
 
 
508 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  31.09 
 
 
516 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.62 
 
 
495 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  33.87 
 
 
528 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  31.87 
 
 
516 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  33.96 
 
 
543 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  29.84 
 
 
515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  36.4 
 
 
520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  29.71 
 
 
501 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  29.52 
 
 
506 aa  174  5e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  31.62 
 
 
524 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.49 
 
 
495 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  32.11 
 
 
519 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  33.13 
 
 
495 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  32.63 
 
 
534 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 
518 aa  171  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  27.39 
 
 
472 aa  170  5e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 
541 aa  169  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  30.54 
 
 
553 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  30.46 
 
 
532 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>