More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2281 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
477 aa  955    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  77.9 
 
 
521 aa  754    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  70.82 
 
 
521 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  63.74 
 
 
507 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  63.52 
 
 
507 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  58.3 
 
 
525 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  58.81 
 
 
516 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  52.7 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  45.79 
 
 
542 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  45.56 
 
 
510 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  38.9 
 
 
502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  39.77 
 
 
522 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  37.88 
 
 
505 aa  279  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  39.24 
 
 
520 aa  267  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  36.38 
 
 
529 aa  259  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  36.69 
 
 
526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  36.16 
 
 
528 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  37.44 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  32.9 
 
 
553 aa  219  6e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
554 aa  219  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  30.92 
 
 
510 aa  219  7.999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  33.19 
 
 
552 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  32.91 
 
 
513 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  35.65 
 
 
507 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  31.07 
 
 
560 aa  203  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  33.61 
 
 
589 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  31.5 
 
 
530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  37.43 
 
 
505 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  33.89 
 
 
590 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  32.13 
 
 
532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 
504 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  31.61 
 
 
550 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  34.11 
 
 
590 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  30.85 
 
 
537 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  38.62 
 
 
524 aa  196  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  31.89 
 
 
532 aa  196  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  28.89 
 
 
537 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  30.57 
 
 
505 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  34.34 
 
 
505 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  35.39 
 
 
520 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  34.34 
 
 
505 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  32.24 
 
 
506 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2709  apolipoprotein N-acyltransferase  35.62 
 
 
604 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  30.35 
 
 
509 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  31.74 
 
 
634 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 
509 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  34.34 
 
 
505 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 
511 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  32.7 
 
 
528 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  31.86 
 
 
514 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  33.08 
 
 
532 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  29.91 
 
 
506 aa  189  1e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  29.44 
 
 
545 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  33.12 
 
 
523 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
515 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
515 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 
507 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  32.72 
 
 
532 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
515 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  33.12 
 
 
523 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  29.48 
 
 
509 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  31.54 
 
 
512 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
518 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  31.82 
 
 
511 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  29.56 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  31.81 
 
 
521 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
526 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.54 
 
 
518 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.45 
 
 
509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  31.47 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  33.91 
 
 
505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  33.55 
 
 
514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  32.51 
 
 
516 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  29.16 
 
 
529 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  29.16 
 
 
529 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  29.38 
 
 
501 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  29.16 
 
 
529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  32.72 
 
 
519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
537 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  31.88 
 
 
516 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  33.48 
 
 
536 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  33.02 
 
 
506 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  33.56 
 
 
535 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  32.7 
 
 
519 aa  182  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  32.24 
 
 
503 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  31.19 
 
 
500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  33.5 
 
 
534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  31.97 
 
 
507 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 
475 aa  181  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 
512 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  31.37 
 
 
510 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.95 
 
 
503 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  34.63 
 
 
531 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  28.35 
 
 
485 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  30.98 
 
 
504 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  31.28 
 
 
534 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  31.03 
 
 
497 aa  177  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  33.9 
 
 
541 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>