More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0821 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
518 aa  1045    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  62.33 
 
 
530 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  94.55 
 
 
514 aa  935    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2147  apolipoprotein N-acyltransferase  36.17 
 
 
525 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148347  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  33.08 
 
 
510 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  31.01 
 
 
521 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  32.74 
 
 
525 aa  209  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  32.11 
 
 
542 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.48 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  33.13 
 
 
507 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.39 
 
 
507 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.19 
 
 
477 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.79 
 
 
521 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  27.65 
 
 
553 aa  172  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  28.78 
 
 
529 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  29.17 
 
 
634 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  31.6 
 
 
506 aa  163  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  26.47 
 
 
526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  29.42 
 
 
520 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  35.77 
 
 
522 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 
519 aa  143  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  30.26 
 
 
530 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  32.63 
 
 
528 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2709  apolipoprotein N-acyltransferase  30.97 
 
 
604 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  28.8 
 
 
525 aa  134  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  34.87 
 
 
502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09770  apolipoprotein N-acyltransferase  27.36 
 
 
488 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  28.13 
 
 
560 aa  133  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  27.92 
 
 
554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  30.9 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  25.2 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
497 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  31.45 
 
 
541 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  27.66 
 
 
545 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  37.05 
 
 
495 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  35.27 
 
 
495 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  33.71 
 
 
524 aa  127  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
500 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  29.83 
 
 
589 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  30.97 
 
 
535 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  31.13 
 
 
531 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  29.09 
 
 
506 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  30.75 
 
 
532 aa  124  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  32.91 
 
 
536 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
557 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 
590 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 
521 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  34.04 
 
 
508 aa  123  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  30.7 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.09 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
505 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  36.16 
 
 
495 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  29.61 
 
 
507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  23.96 
 
 
544 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  29.25 
 
 
505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.62 
 
 
517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4463  apolipoprotein N-acyltransferase  28.89 
 
 
528 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  29.25 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  27.86 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.3 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31.3 
 
 
536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  32.86 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  28.86 
 
 
509 aa  117  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  27.17 
 
 
541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  30.25 
 
 
590 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  28.77 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
489 aa  116  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  31.97 
 
 
511 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 
505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  31.23 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  26.31 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  26.31 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  26.31 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  29.02 
 
 
521 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  25.44 
 
 
537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  28.29 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  30.54 
 
 
536 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  27.31 
 
 
529 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  29.94 
 
 
509 aa  113  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  28.77 
 
 
515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  26.58 
 
 
512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  27.06 
 
 
523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  28.78 
 
 
505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.52 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.03 
 
 
512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  26.29 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.1 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  26.51 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  28.06 
 
 
504 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  30.54 
 
 
543 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
529 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  28.92 
 
 
543 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
529 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>