More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3440 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
514 aa  1036    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  62.99 
 
 
530 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  94.55 
 
 
518 aa  935    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2147  apolipoprotein N-acyltransferase  36.55 
 
 
525 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148347  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  31.42 
 
 
521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  31.82 
 
 
542 aa  206  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 
525 aa  206  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 
507 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.68 
 
 
507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  33.01 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 
477 aa  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.36 
 
 
521 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  27.88 
 
 
553 aa  176  8e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  29.48 
 
 
529 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  29.2 
 
 
634 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.68 
 
 
506 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  27.22 
 
 
526 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  27.39 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  32.39 
 
 
519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 
520 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  29.11 
 
 
475 aa  147  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  27.03 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  29.87 
 
 
526 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  35.77 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 
528 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  28.79 
 
 
525 aa  140  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2709  apolipoprotein N-acyltransferase  31.37 
 
 
604 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  28.88 
 
 
545 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  29.59 
 
 
506 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  30.53 
 
 
530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  27.14 
 
 
502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
523 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
523 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  28.77 
 
 
560 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.59 
 
 
506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  35.23 
 
 
495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 
541 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  25.27 
 
 
544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  28.74 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  30.21 
 
 
589 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  30.5 
 
 
528 aa  130  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  30.47 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  29.69 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  30.06 
 
 
590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  27.57 
 
 
521 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  32.13 
 
 
536 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09770  apolipoprotein N-acyltransferase  27.09 
 
 
488 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  34.91 
 
 
495 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  33.24 
 
 
524 aa  127  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
505 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  31.07 
 
 
531 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 
517 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.42 
 
 
479 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  30.1 
 
 
505 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  30.12 
 
 
557 aa  124  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  32.03 
 
 
505 aa  123  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  27.29 
 
 
554 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  30.7 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  36.94 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  29.78 
 
 
534 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  29.42 
 
 
590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  32.47 
 
 
511 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  27.73 
 
 
541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  29.84 
 
 
507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  28.84 
 
 
507 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  33.21 
 
 
511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  30.37 
 
 
532 aa  120  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  29.6 
 
 
509 aa  120  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
489 aa  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4463  apolipoprotein N-acyltransferase  29.32 
 
 
528 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  26.13 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  26.13 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  27.44 
 
 
529 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  26.13 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.35 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  30.75 
 
 
536 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  29.42 
 
 
505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  26.8 
 
 
512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  26.54 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  28.4 
 
 
523 aa  117  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.24 
 
 
529 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  27.03 
 
 
529 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  27.03 
 
 
529 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  26.85 
 
 
507 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  28.54 
 
 
509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  29.79 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  30.1 
 
 
505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  27.24 
 
 
529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  27.14 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  27.69 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  27.14 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  29.25 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  28.8 
 
 
521 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  25.62 
 
 
506 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  27.14 
 
 
512 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.71 
 
 
524 aa  114  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  29.91 
 
 
515 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  30.86 
 
 
536 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>