More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0044 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 543 aa  1074    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  59.47 
 
 		 534 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  57.92 
 
 		 534 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  58 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  56.8 
 
 		 532 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  57.81 
 
 		 532 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  58.01 
 
 		 532 aa  557  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  43.67 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  42.91 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  46.11 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  42.51 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  42.69 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  43.23 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  42.47 
 
 		 536 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  43.68 
 
 		 536 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  44.94 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  42.2 
 
 		 534 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  44.34 
 
 		 567 aa  346  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  44.34 
 
 		 567 aa  346  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  42.6 
 
 		 540 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  41.12 
 
 		 550 aa  333  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  39.96 
 
 		 576 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  44.53 
 
 		 566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  43.02 
 
 		 553 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  39.26 
 
 		 557 aa  316  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  38.64 
 
 		 531 aa  259  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  38.27 
 
 		 495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  38.07 
 
 		 495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  35.98 
 
 		 537 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  37.22 
 
 		 495 aa  236  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  37.04 
 
 		 508 aa  232  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  36.23 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  36.23 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  36.31 
 
 		 528 aa  226  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  34.74 
 
 		 525 aa  220  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  36.81 
 
 		 502 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  29.96 
 
 		 501 aa  207  4e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  29.3 
 
 		 488 aa  203  6e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  36.04 
 
 		 487 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.03 
 
 		 516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  36.56 
 
 		 497 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  27.83 
 
 		 472 aa  179  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  32.65 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  31.54 
 
 		 525 aa  176  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  36.76 
 
 		 588 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  30.9 
 
 		 507 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  34.9 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 		 507 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  35.21 
 
 		 502 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  31.62 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  35.61 
 
 		 524 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 		 523 aa  167  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  30.75 
 
 		 509 aa  166  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  34.15 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  30.02 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  30.08 
 
 		 553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 		 512 aa  164  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 		 512 aa  164  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  32.8 
 
 		 522 aa  164  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  30.6 
 
 		 512 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  32.28 
 
 		 489 aa  163  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 		 512 aa  163  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  31.48 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  34.65 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  34.25 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.36 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  31.52 
 
 		 505 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  30.61 
 
 		 512 aa  159  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  27.8 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  34.43 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.92 
 
 		 524 aa  157  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  32.88 
 
 		 509 aa  157  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.28 
 
 		 509 aa  156  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  31.85 
 
 		 521 aa  156  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  32.33 
 
 		 524 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  34.19 
 
 		 523 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  29.67 
 
 		 506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  31.82 
 
 		 532 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 506 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  30.17 
 
 		 542 aa  154  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 		 509 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 		 500 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  30.53 
 
 		 506 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.49 
 
 		 479 aa  153  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  32.19 
 
 		 562 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  30.73 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>