296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1708 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
544 aa  1105    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  29.16 
 
 
507 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  29.29 
 
 
507 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.22 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  27.57 
 
 
525 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  27.21 
 
 
510 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  26.64 
 
 
760 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  29.21 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  26.59 
 
 
542 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  26.93 
 
 
525 aa  162  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
516 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  28.44 
 
 
553 aa  160  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  25.34 
 
 
519 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  26.01 
 
 
526 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  26.91 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  25.65 
 
 
537 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  25.55 
 
 
554 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  26.7 
 
 
545 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  26.31 
 
 
537 aa  140  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  25.28 
 
 
560 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  26.13 
 
 
529 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  24.82 
 
 
514 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  24.03 
 
 
530 aa  133  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  22.65 
 
 
634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  24.65 
 
 
491 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  26.78 
 
 
487 aa  125  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  25.05 
 
 
550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  23.58 
 
 
518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  25.98 
 
 
522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  27.74 
 
 
533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  25.55 
 
 
487 aa  120  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  26.57 
 
 
510 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  38.64 
 
 
488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  24.06 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2147  apolipoprotein N-acyltransferase  31.1 
 
 
525 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148347  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  24.57 
 
 
475 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  24.66 
 
 
509 aa  113  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  24.01 
 
 
527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  25.32 
 
 
479 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  25.78 
 
 
489 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  24.88 
 
 
505 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 
537 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  24.24 
 
 
509 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  25.99 
 
 
532 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  24.77 
 
 
529 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  25.64 
 
 
509 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  24.77 
 
 
529 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  30.14 
 
 
505 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  24.77 
 
 
529 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  24.7 
 
 
501 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  25.62 
 
 
520 aa  107  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  24.77 
 
 
529 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  25.48 
 
 
515 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4185  apolipoprotein N-acyltransferase  29.45 
 
 
518 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  24.55 
 
 
529 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  24.36 
 
 
536 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1364  apolipoprotein N-acyltransferase  25.52 
 
 
488 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00243577  hitchhiker  0.000524625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  25.3 
 
 
528 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  24.06 
 
 
511 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  24.04 
 
 
512 aa  103  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  24.58 
 
 
536 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  25.54 
 
 
506 aa  103  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  24.04 
 
 
512 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  24.04 
 
 
512 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  24.18 
 
 
512 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  23.93 
 
 
530 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  24.81 
 
 
497 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  24.18 
 
 
508 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  24.04 
 
 
512 aa  101  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  23.82 
 
 
512 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  22.65 
 
 
523 aa  101  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  24.04 
 
 
512 aa  101  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  27.33 
 
 
551 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  27.93 
 
 
532 aa  100  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  23.82 
 
 
512 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  24.08 
 
 
521 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  24.33 
 
 
537 aa  100  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1342  apolipoprotein N-acyltransferase  27.85 
 
 
458 aa  99.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.370608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  28 
 
 
532 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  23.85 
 
 
536 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  27.66 
 
 
532 aa  98.6  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  25.43 
 
 
510 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  23.61 
 
 
507 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0821  apolipoprotein N-acyltransferase  25.11 
 
 
542 aa  97.8  4e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  23.81 
 
 
512 aa  97.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  33.53 
 
 
487 aa  97.4  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  23.98 
 
 
511 aa  97.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  24.81 
 
 
524 aa  97.1  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  24.17 
 
 
534 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  22.65 
 
 
528 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  24.57 
 
 
472 aa  96.3  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  23.65 
 
 
509 aa  96.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  24.57 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  26.51 
 
 
501 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  24.67 
 
 
497 aa  95.9  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0477  apolipoprotein N-acyltransferase  26.03 
 
 
488 aa  95.1  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  34.48 
 
 
520 aa  94.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09770  apolipoprotein N-acyltransferase  23.57 
 
 
488 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>