299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1507 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
501 aa  954    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  28.71 
 
 
538 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  33.19 
 
 
520 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  32.23 
 
 
554 aa  156  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  29 
 
 
526 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  27.81 
 
 
560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
545 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  24.95 
 
 
527 aa  140  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  32.24 
 
 
506 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
542 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  27.62 
 
 
537 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  27.37 
 
 
533 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  29.07 
 
 
507 aa  134  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.3 
 
 
516 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.32 
 
 
521 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  38.46 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  31.53 
 
 
502 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  29.07 
 
 
507 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  22.98 
 
 
488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  27.33 
 
 
537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  28.51 
 
 
519 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  30.1 
 
 
525 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  27.91 
 
 
526 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  29.83 
 
 
522 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  33.94 
 
 
528 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1141  apolipoprotein N-acyltransferase  33.89 
 
 
464 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0258943  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  28.76 
 
 
509 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0666  apolipoprotein N-acyltransferase  25.46 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  27.29 
 
 
475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  22.95 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  28.8 
 
 
509 aa  118  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  28.25 
 
 
506 aa  117  3e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  27.37 
 
 
487 aa  117  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0412  apolipoprotein N-acyltransferase  26.39 
 
 
539 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.107185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  27.61 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 
487 aa  115  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  25.41 
 
 
510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  26.62 
 
 
515 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  26.62 
 
 
515 aa  114  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  26.62 
 
 
515 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  27.24 
 
 
512 aa  113  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  23.27 
 
 
537 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  23.01 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  27.35 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.24 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  27.18 
 
 
512 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  27.18 
 
 
512 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  30.37 
 
 
532 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  26.83 
 
 
512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  26.98 
 
 
512 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.03 
 
 
512 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  31.88 
 
 
528 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2199  apolipoprotein N-acyltransferase  34.17 
 
 
522 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.03 
 
 
529 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  27.03 
 
 
529 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  26.43 
 
 
529 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  28.45 
 
 
550 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  37.04 
 
 
552 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  26.43 
 
 
529 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  28.03 
 
 
508 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  26.98 
 
 
512 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  26.43 
 
 
529 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  30.14 
 
 
489 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  28.03 
 
 
512 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2147  apolipoprotein N-acyltransferase  31.27 
 
 
525 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148347  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4185  apolipoprotein N-acyltransferase  33.6 
 
 
518 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2388  apolipoprotein N-acyltransferase  32.21 
 
 
543 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733975  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  27.92 
 
 
529 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  24.22 
 
 
532 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1874  apolipoprotein N-acyltransferase  30.43 
 
 
552 aa  104  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  21.9 
 
 
553 aa  104  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  31.08 
 
 
532 aa  104  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  31.08 
 
 
532 aa  104  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  30.74 
 
 
487 aa  103  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  34.31 
 
 
883 aa  103  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 
517 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 
506 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.8 
 
 
503 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  29.44 
 
 
541 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  28.99 
 
 
514 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  29.6 
 
 
503 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2666  apolipoprotein N-acyltransferase  28.48 
 
 
551 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2204  apolipoprotein N-acyltransferase  27.7 
 
 
552 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1364  apolipoprotein N-acyltransferase  29.64 
 
 
488 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00243577  hitchhiker  0.000524625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2269  apolipoprotein N-acyltransferase  31.22 
 
 
559 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937964  normal  0.125706 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0752  apolipoprotein N-acyltransferase  27.91 
 
 
506 aa  100  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179484 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0601  apolipoprotein N-acyltransferase  27.91 
 
 
501 aa  100  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.180307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  32.23 
 
 
551 aa  100  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  26.87 
 
 
523 aa  100  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  33.88 
 
 
530 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  26.33 
 
 
544 aa  99.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  27.53 
 
 
497 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.27 
 
 
573 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  25.99 
 
 
524 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1210  apolipoprotein N-acyltransferase  31.89 
 
 
540 aa  97.8  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  30.06 
 
 
500 aa  97.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>